RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 PITPNAQ00169 270 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CDNFQ49AH0 187 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ESCO2Q56NI9 601 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PYDC2Q56P42 97 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SHEQ5VZ18 495 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 S100ZQ8WXG8 99 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SNX22Q96L94 193 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 IFT46Q9NQC8 304 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ING3Q9NXR8 418 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CTSZQ9UBR2 303 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUX4Q9UBX2 424 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 AK3Q9UIJ7 227 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ITPR2Q14571 2701 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DYSFO75923 2080 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 VWC2LB2RUY7 222 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 H7C1Q1 480 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 K7N7A8 449 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DVL1O14640 695 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FSHBP01225 129 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV2-5P01817 119 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TK1P04183 234 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 LPLP06858 475 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 LMO1P25800 156 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PRSS3P35030 304 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 GLP1RP43220 463 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CBX5P45973 191 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM50BP56557 158 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF45Q02386 682 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF846Q147U1 533 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 HACD4Q5VWC8 232 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SETD6Q8TBK2 473 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 Q96MF0 132 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FOXC2Q99958 501 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CLN8Q9UBY8 286 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 KIF25Q9UIL4 384 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1W2PQ09 198 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ODAMA1E959 279 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 CTDSPLO15194 276 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 FCGR3AP08637 254 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 PTHLHP12272 177 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 DTYMKP23919 212 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 RCVRNP35243 200 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 INPP1P49441 399 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 NPY4RP50391 375 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ACTBP60709 375 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 GNB2P62879 340 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ACTG1P63261 375 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 DGCR2P98153 550 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 PAX5Q02548 391 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 AESQ08117 197 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF79Q15937 498 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 C6orf183Q5T699 404 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 TRIQKQ629K1 86 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.33□□□□□ -1.4
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