RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	RPEL1	Q2QD12	228 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	SPINK2	P20155	84 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	CYC1	P08574	325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	DANCR	P0C864	163 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	GAS1	P54826	345 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	IGFBP7	Q16270	282 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	ACER2	Q5QJU3	275 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	CXorf65	A6NEN9	183 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	FBP1	P09467	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	RND3	P61587	244 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	DTD1	Q8TEA8	209 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	RARRES2	Q99969	163 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	LINC01387	J3KSC0	135 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF708	P17019	499 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	BCL3	P20749	454 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	CASP6	P55212	293 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MEGF6-205	ENST00000485002	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	PRF1	P14222	555 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	S100A7	P31151	101 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	SRD5A2	P31213	254 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	SERF2	P84101	59 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	SVIL	O95425	2214 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	PGA4	P0DJD7	388 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	HOXA6	P31267	233 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	GUSBP11	Q6P575	273 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	RSG1	Q9BU20	258 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		13.71	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A0U1RQV5	110 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	EFNB1	P98172	346 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	PAX5	Q02548	391 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	OR5I1	Q13606	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	PSG2	P11465	335 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	TFF2	Q03403	129 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	TSPAN2	O60636	221 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	IL2RA	P01589	272 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	CNIH1	O95406	144 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	CRYAA	P02489	173 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A1B0GTQ1	180 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	EGR4	Q05215	589 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		13.69	□□□□□ -0.22
MEGF6-205	ENST00000485002	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms