RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 FCGR1AP12314 374 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNJ3P48549 501 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXE3Q13461 319 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR50Q13585 617 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 IL13RA2Q14627 380 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DS1Q14954 304 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A30Q5SVS4 291 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8N9W7 124 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 PXT1Q8NFP0 134 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS12Q96DT0 336 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCG5Q9H222 651 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SORL1Q92673 2214 aa7.36□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM212A6NML5 194 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 E9PI62 339 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 GABRPO00591 440 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ELANEP08246 267 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 VEGFCP49767 419 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 CFHR3Q02985 330 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 FHL3Q13643 280 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 RSU1Q15404 277 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF529Q6P280 563 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM104Q8NE00 496 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 UBALD1Q8TB05 177 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 GPER1Q99527 375 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ALG8Q9BVK2 526 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 AASSQ9UDR5 926 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 DHDHQ9UQ10 334 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 C15orf65H3BRN8 121 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 MPZL2O60487 215 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHG4P01861 327 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ALPLP05186 524 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB3AP20336 220 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 GALEQ14376 348 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ASCL4Q6XD76 172 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SATL1Q86VE3 508 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SYS1Q8N2H4 156 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00311Q8N616 119 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL11Q969Q4 196 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 S1PR3Q99500 378 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 GON7Q9BXV9 100 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 IFT22Q9H7X7 185 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-210ENST00000481231 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC31A2O15432 143 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEB3O15480 346 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CDRT1O95170 752 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 HTR3BO95264 441 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MOSP00540 346 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms