RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 RAB9BQ9NP90 201 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ERGIC3Q9Y282 383 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TRAV39A0A0B4J263 110 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PPK0 400 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 G3V4G9 280 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 C15orf65H3BRN8 121 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 CCRL2O00421 344 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 CA11O75493 328 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV3-7P01780 117 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 LPLP06858 475 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 GNAO1P09471 354 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 CELP19835 753 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 WNT4P56705 351 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 EBI3Q14213 229 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 LTC4SQ16873 150 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 Q3ZCU0 254 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 UTF1Q5T230 341 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 STEAP3Q658P3 488 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 REC114Q7Z4M0 266 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 C1QL4Q86Z23 238 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 LYG1Q8N1E2 194 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00311Q8N616 119 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 DRAM1Q8N682 238 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 NEK7Q8TDX7 302 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TFAP2CQ92754 450 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 LEAP2Q969E1 77 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ORAI1Q96D31 301 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 DERL3Q96Q80 235 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 VCXQ9H320 206 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 DCLRE1BQ9H816 532 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 GHRLQ9UBU3 117 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PP11 408 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PPI3 338 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 H0YHG0 523 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 AIPO00170 330 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MYL12BO14950 172 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 PIN1P1O15428 100 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 SPINT2O43291 252 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FGF16O43320 207 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MAS1P04201 325 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM11P17152 192 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FUT3P21217 361 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 IL3RAP26951 378 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 SSTR5P35346 364 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 GNG10P50151 68 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 LOXL3P58215 753 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 GPR50Q13585 617 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 HES1Q14469 280 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FBLN7Q53RD9 439 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 C9orf152Q5JTZ5 239 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 C6orf183Q5T699 404 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 AWAT2Q6E213 333 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 AHSA2Q719I0 299 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MOB3BQ86TA1 216 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 LYPD6Q86Y78 171 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 GAPTQ8N292 157 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 OR56B4Q8NH76 319 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC107Q8WV48 283 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MYDGFQ969H8 173 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 MUL1Q969V5 352 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 OR14A2Q96R54 314 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 FKBP14Q9NWM8 211 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 SCN3BQ9NY72 215 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ETAA1Q9NY74 926 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF581Q9P0T4 197 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms