RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 BTN2A1Q7KYR7 527 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8N402 240 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CST11Q9H112 138 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 METRNQ9UJH8 293 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 J3QLI3 93 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SSX5O60225 188 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF737O75373 536 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 BPNT1O95861 308 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2H2O95918 312 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 TK1P04183 234 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 LIPFP07098 398 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF44P15621 663 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PAX2Q02962 417 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6P435 159 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A28Q96A46 364 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP26Q9NRE1 261 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM82A0PJX8 343 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 C22orf46C9J442 243 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 GABRR1P24046 479 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 CFPP27918 469 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10A3P58181 314 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 MPV17LQ2QL34 196 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PIGYQ3MUY2 71 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0G2JK05 382 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PP11 408 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 C7orf66A4D0T2 115 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 IFITM5A6NNB3 132 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SIRPB1O00241 398 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FABP7O15540 132 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 VSIG8P0DPA2 414 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 MGMTP16455 207 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 MXD1Q05195 221 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 P2RY14Q15391 338 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 Q3ZCU0 254 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 FGFRL1Q8N441 504 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 BANF2Q9H503 90 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 MED9Q9NWA0 146 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF25Q9UIL4 384 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SMLR1H3BR10 107 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 AIPO00170 330 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 MGST3O14880 152 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PSPNO60542 156 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 SNAPC5O75971 98 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 INPP1P49441 399 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PAX8Q06710 450 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 PDCD1Q15116 288 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 HES5Q5TA89 166 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 CNIH2Q6PI25 160 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX29Q8N6K0 151 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM104Q8NE00 496 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms