RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 ZNF846Q147U1 533 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 CDNFQ49AH0 187 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 BRICD5Q6PL45 260 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 DCDC5Q6ZRR9 648 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 RTN4RL2Q86UN3 420 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 SNX29P2Q8IUI4 249 aa10.23□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 ST8SIA4Q92187 359 aa10.23□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 DNTTIP1Q9H147 329 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.23□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 ARFRP1Q13795 201 aa10.21□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 OR4S1Q8NGB4 309 aa10.21□□□□□ -0.77
PRAME-208ENST00000438888 MED30Q96HR3 178 aa10.21□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 CHST6Q9GZX3 395 aa10.21□□□□□ -0.77
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PRAME-208ENST00000438888 DUX4L2P0CJ85 424 aa10.2□□□□□ -0.78
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PRAME-208ENST00000438888 DUX4L6P0CJ89 424 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-208ENST00000438888 DUX4L7P0CJ90 424 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-208ENST00000438888 CD40LGP29965 261 aa10.2□□□□□ -0.78
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PRAME-208ENST00000438888 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-208ENST00000438888 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-208ENST00000438888 GRK1Q15835 563 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-208ENST00000438888 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-208ENST00000438888 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-208ENST00000438888 OR8H2Q8N162 312 aa10.2□□□□□ -0.78
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