RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.98□□□□□ -0.01
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PTPRF-209ENST00000438120 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 25.8
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PTPRF-209ENST00000438120 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.98□□□□□ -0.01
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PTPRF-209ENST00000438120 CA10Q9NS85 328 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRF-209ENST00000438120 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.97□□□□□ -0.01
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PTPRF-209ENST00000438120 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.97□□□□□ -0.01
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PTPRF-209ENST00000438120 Q8WTZ3 238 aa14.97□□□□□ -0.01
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PTPRF-209ENST00000438120 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRF-209ENST00000438120 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.96□□□□□ -0.01
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PTPRF-209ENST00000438120 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRF-209ENST00000438120 M0R2Z0 102 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 COL8A1P27658 744 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 SLC25A45Q8N413 288 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.96□□□□□ -0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.95□□□□□ -0.02
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PTPRF-209ENST00000438120 FDX2Q6P4F2 183 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 PRSS50Q9UI38 385 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 PLA2G10O15496 165 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 GGTLC2Q14390 218 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PP11 408 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRF-209ENST00000438120 J3QR06 171 aa14.95□□□□□ -0.02
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