RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 AQP2P41181 271 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZP1P60852 638 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ERVK-25P63136 954 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF117Q03924 483 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZMYND11Q15326 602 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 FCN2Q15485 313 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 GRK1Q15835 563 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 CLLU1Q5K131 121 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 LCE1FQ5T754 118 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 TEX261Q6UWH6 196 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 LYPD6Q86Y78 171 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 OR6N1Q8NGY5 312 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF671Q8TAW3 534 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF519Q8TB69 540 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 GPR119Q8TDV5 335 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 C4orf45Q96LM5 186 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 Q96M85 177 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 INTS14Q96SY0 518 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 TBX5Q99593 518 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf198Q9H425 327 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 NUDT15Q9NV35 164 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 GNG8Q9UK08 70 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 COPS3Q9UNS2 423 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SIGLEC9Q9Y336 463 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 U3KQ87 197 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 PLSCR5A0PG75 271 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 P2RY10O00398 339 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 PLPP3O14495 311 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 XKRYO14609 159 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 LDLRAD4O15165 306 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 DOK2O60496 412 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SELENOFO60613 162 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 PMS2P2O95744 297 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 QDPRP09417 244 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 CD3GP09693 182 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 RCVRNP35243 200 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 KIR2DS4P43632 304 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 OR3A3P47888 321 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ACTBP60709 375 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 FGF12P61328 243 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35A1P78382 337 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 HNF4GQ14541 408 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 CD226Q15762 336 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM155Q4W5P6 130 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 MESTQ5EB52 335 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 CLVS2Q5SYC1 327 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM244Q5VVB8 128 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 RAB12Q6IQ22 244 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 CBLN3Q6UW01 205 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 KRT74Q7RTS7 529 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 MDP1Q86V88 176 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF614Q8N883 585 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF680Q8NEM1 530 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-211ENST00000429595 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms