RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NAXEQ8NCW5 288 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NEK7Q8TDX7 302 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NRIP2Q9BQI9 281 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.51□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 F8VVB4 439 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 F8VWA3 439 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LILRA1O75019 489 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TUSC2O75896 110 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 WISP2O76076 250 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PPYP01298 95 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RLN2P04090 185 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CECR9P0C854 216 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 IGFBP2P18065 325 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PI3P19957 117 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 S100GP29377 79 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 KCNJ3P48549 501 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 Q6P435 159 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 BRICD5Q6PL45 260 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LGI3Q8N145 548 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 GAPTQ8N292 157 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 POC1AQ8NBT0 407 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RND1Q92730 232 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MDFIQ99750 246 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 OR51B6Q9H340 312 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PIGMQ9H3S5 423 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RASL12Q9NYN1 266 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RDH8Q9NYR8 311 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PR80 420 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RNF222A6NCQ9 220 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TAAR5O14804 337 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 WNT2P09544 360 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 AADACP22760 399 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NAAAQ02083 359 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM187Q14656 261 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SMCO1Q147U7 214 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PDCD1Q15116 288 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 DYRK2Q92630 601 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TOMM40LQ969M1 308 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MUCL1Q96DR8 90 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RNF126Q9BV68 326 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LIME1Q9H400 295 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 HES4Q9HCC6 221 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MBD2Q9UBB5 411 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LEUTXA8MZ59 168 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 IFNL4K9M1U5 179 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 GPR31O00270 319 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 MPPED1O15442 326 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ADAP1O75689 374 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 NXPH2O95156 264 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RRASP10301 218 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF44P15621 663 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LMO1P25800 156 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF154Q13106 437 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.48□□□□□ -1.05
POLR1A-204ENST00000424089 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms