RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM6P0DI80 62 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ODF3L1Q8IXM7 274 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf49A4QMS7 147 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2C1O95371 312 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-HP01893 362 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHA1P21709 976 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 TCF15Q12870 199 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA12AO43301 675 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 NAPSAO96009 420 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 RND3P61587 244 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 SSPNQ14714 243 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 NIT2Q9NQR4 276 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GW64 132 aa15.97■□□□□ 0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF154Q13106 437 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 DDA1Q9BW61 102 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF732B4DXR9 585 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 C3orf80F5H4A9 247 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST1O43916 411 aa15.97■□□□□ 0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 FTH1P19P0C7X4 201 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 NMSQ5H8A3 153 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8NFD4 153 aa15.97■□□□□ 0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 TXNL1O43396 289 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV2-5P01817 119 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CELA3AP09093 270 aa15.97■□□□□ 0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF727A8MUV8 499 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 VDAC1P21796 283 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP1-202ENST00000417536 CYB561P49447 251 aa15.96■□□□□ 0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.96■□□□□ 0.15
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A18PA6NE21 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.96■□□□□ 0.14
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00587B1AMM8 73 aa15.96■□□□□ 0.14
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SH3BP1-202ENST00000417536 H3BQ15 152 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A15PP0C7V4 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A13PP0C7W8 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 UCP1P25874 307 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 GFRA1P56159 465 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ID3Q02535 119 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF488Q96MN9 340 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 LRFN1Q9P244 771 aa15.96■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BP45 60 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNGR1O43759 233 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FABP1P07148 127 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 CALHM2Q9HA72 323 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP24Q9Y5R2 645 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 APC2O95996 2303 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ACACAQ13085 2346 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM166BA8MTA8 275 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 H0YL77 283 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 TUSC2O75896 110 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXO1Q12778 655 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 CEACAM21Q3KPI0 293 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB39BQ96DA2 213 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTBN4Q9H254 2564 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NGFP01138 241 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 KIR2DS4P43632 304 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS10P46783 165 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 KIR2DS1Q14954 304 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 NCMAPQ5T1S8 102 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.94■□□□□ 0.14
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