RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 FREM3P0C091 2139 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 HKR1P10072 659 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 HYAL1Q12794 435 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 Q5PR19 223 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 OR1L6Q8NGR2 347 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 SOX7Q9BT81 388 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 CLEC1BQ9P126 229 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 CACNA1GO43497 2377 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 A6NNC1 897 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 H0YIZ8 118 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 WDR1O75083 606 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 ACTL6AO96019 429 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 SOD3P08294 240 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 FAHP16930 419 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 CDAP32320 146 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 KIR2DS4P43632 304 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 FHITP49789 147 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 UBE2G1P62253 170 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 KIR2DS1Q14954 304 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM42Q69YG0 159 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 C1QL4Q86Z23 238 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 RAB24Q969Q5 203 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 TMEM230Q96A57 120 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 DIRC3C9JPN6 131 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 APH1AQ96BI3 265 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 G3V3Y1 287 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 RDH5Q92781 318 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-205ENST00000397611 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 SIRPB1O00241 398 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 SRFP11831 508 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 RAB35Q15286 201 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-205ENST00000397611 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.75□□□□□ -1.65
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