RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM234Q8WY98 164 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BTF3L4Q96K17 158 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MSL2Q9HCI7 577 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 B4DGG1 531 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 K7ESF4 209 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IFNL4K9M1U5 179 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DHRS3O75911 302 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WNT5AP41221 380 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SDSLQ96GA7 329 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LYZL4Q96KX0 146 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EMC6Q9BV81 110 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRRC3CA6NJW4 275 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 H0YIG0 161 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHST1O43916 411 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDAH2O95865 285 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PAX9P55771 341 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDCP2Q5VXM1 449 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCNIP4Q6PIL6 250 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM106BQ9NUM4 274 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNF115Q9Y4L5 304 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1W2PNV4 684 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RER1O15258 196 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AADACP22760 399 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTSSP25774 331 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UCP1P25874 307 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CXCL12P48061 93 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAB7AP51149 207 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SERF2P84101 59 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRSS8Q16651 343 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SSX7Q7RTT5 188 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDIT4LQ96D03 193 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C10orf35Q96D05 121 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PGAM5Q96HS1 289 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLK3Q9H4B4 646 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL6A3P12111 3177 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A0U1RQV5 110 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 E9PLN8 166 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF737O75373 536 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPYP01298 95 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HLA-HP01893 362 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VDAC1P21796 283 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MDH2P40926 338 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPL15P61313 204 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HHEXQ03014 270 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OR8B8Q15620 311 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 Q6ZSR3 168 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UEVLDQ8IX04 471 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF721Q8TF20 911 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RSG1Q9BU20 258 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VSIRQ9H7M9 311 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIAS2O75928 621 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCN2P20062 427 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SOX8P57073 446 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIGTQ969N2 578 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RASL10BQ96S79 203 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAHP16930 419 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDKN1BP46527 198 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLRN1P58418 232 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM256Q8N2U0 113 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LMX1AQ8TE12 382 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ST8SIA1Q92185 356 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP34Q70CQ2 3546 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LILRA1O75019 489 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SELENOTP62341 195 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PAFAH1B2P68402 229 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RTP5Q14D33 572 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TBC1D26Q86UD7 250 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC35E1Q96K37 410 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VENTXO95231 258 aa15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms