RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CLDN15P56746 228 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 RPS18P62269 152 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 DUSP23Q9BVJ7 150 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 GPR35Q9HC97 309 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 CRIM1Q9NZV1 1036 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 H0Y980 276 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 FGF5P12034 268 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 MLF1P58340 268 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 OR8G1Q15617 311 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 FAM90A2PQ658T7 463 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 ZNF600Q6ZNG1 722 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 THNSL2Q86YJ6 484 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 HIST3H2BBQ8N257 126 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 OR10G4Q8NGN3 311 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 OR13D1Q8NGV5 346 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 OPA3Q9H6K4 179 aa12.78□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 NCKAP5O14513 1909 aa12.77□□□□□ -0.36
SYP-201ENST00000263233 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 H3BP45 60 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 SRD5A2P31213 254 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 CD200P41217 278 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 HAAOP46952 286 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 FGF12P61328 243 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 IL22RA2Q969J5 263 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 GPR61Q9BZJ8 451 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 PRDM14Q9GZV8 571 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 GNG13Q9P2W3 67 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 PDZD11Q5EBL8 140 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 OR56B2PQ8NGI1 322 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ABHD5Q8WTS1 349 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 KCNE4Q8WWG9 221 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 PRDM13Q9H4Q3 707 aa12.77□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 FREM2Q5SZK8 3169 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 B4DEV8 164 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ZNHIT1O43257 154 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 DFFBO76075 338 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 TRGC1P0CF51 173 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 RAB11AP62491 216 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 PRDX4Q13162 271 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 SLC23A3Q6PIS1 610 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 COLCA1Q6ZS62 124 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 STX12Q86Y82 276 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 AGBL5Q8NDL9 886 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 OR10D3Q8NH80 312 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 GPR146Q96CH1 333 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ADGRG7Q96K78 797 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 FSCN3Q9NQT6 498 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ATP23Q9Y6H3 246 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 PPP1R2P9O14990 202 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 RFPL3SP0C7P2 107 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 KIR2DS4P43632 304 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 GPM6AP51674 278 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 KIR2DS1Q14954 304 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 MPV17LQ2QL34 196 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 FRZBQ92765 325 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 FAM210BQ96KR6 192 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 MTCH1Q9NZJ7 389 aa12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 F10P00742 488 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 IFNA5P01569 189 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 IGHV3-9P01782 118 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 F2RP25116 425 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 OR2T2Q6IF00 324 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 PCSK4Q6UW60 755 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 SPEM1Q8N4L4 309 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 NEK7Q8TDX7 302 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 SAP25Q8TEE9 199 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 RSG1Q9BU20 258 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 VSIRQ9H7M9 311 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 RPRMQ9NS64 109 aa12.75□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ZFP92A6NM28 416 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 HLA-HP01893 362 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 CTXN2P0C2S0 81 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 SLC25A24Q6NUK1 477 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 C20orf204Q6ZNR8 217 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 SAXO1Q8IYX7 474 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 OR2V1Q8NHB1 315 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ABHD3Q8WU67 409 aa12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
SYP-201ENST00000263233 ZNF665Q9H7R5 613 aa12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms