RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 A6NLC8 198 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 CDRT15L2A8MXV6 281 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 TNFSF12O43508 249 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 OMGP23515 440 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 FAM185AQ8N0U4 392 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC18CQ8NCF0 446 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 UCP1P25874 307 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 WNT5AP41221 380 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf170-201ENST00000623052 MED13Q9UHV7 2174 aa11.4□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ARGFXA6NJG6 315 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 LAMTOR5O43504 91 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PRH1P02810 166 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PAX9P55771 341 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 GNMTQ14749 295 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf78Q8N4C9 275 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 POM121Q96HA1 1249 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 DOCK7Q96N67 2140 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 MED12LQ86YW9 2145 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV24A0A0B4J272 114 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 UMAD1C9J7I0 102 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF695Q8IW36 515 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 YPEL4Q96NS1 127 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ATP23Q9Y6H3 246 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 R4GN57 208 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC13O75165 2243 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TK1P04183 234 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PTAFRP25105 342 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RAB5CP51148 216 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SRPXP78539 464 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ID3Q02535 119 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 HMGN3Q15651 99 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.39□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PR64 198 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PRV1 198 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR13C7P0DN81 318 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 AGAP20933 346 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 DYNLT3P51808 116 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RUNX1Q01196 453 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 GUCD1Q96NT3 240 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GW64 132 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PPE2 198 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 CST7O76096 145 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV2-14P01704 120 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ARG1P05089 322 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 MPV17LQ2QL34 196 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 LOC400499M0QZD8 3231 aa11.38□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 C5orf52A6NGY3 159 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RHBDL1O75783 438 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 COX5BP10606 129 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 RAB1AP62820 205 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 CTAG1AP78358 180 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 DBX2Q6ZNG2 339 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 TAAR9Q96RI9 348 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS50Q9UI38 385 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 CD300LBA8K4G0 201 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF154Q13106 437 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 OR1C1Q15619 314 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 HAGHQ16775 308 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.37□□□□□ -0.59
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms