RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 OR8B3Q8NGG8 313 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 OR8B2Q96RD0 313 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 DMRTA2Q96SC8 542 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRJ-207ENST00000613246 OR13C6PQ8NH95 151 aa16.52■□□□□ 0.24
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PTPRJ-207ENST00000613246 SLC35B1P78383 322 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
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PTPRJ-207ENST00000613246 TM4SF20Q53R12 229 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 C4orf45Q96LM5 186 aa16.51■□□□□ 0.23
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PTPRJ-207ENST00000613246 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa16.51■□□□□ 0.23
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PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM127O75204 238 aa16.5■□□□□ 0.23
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PTPRJ-207ENST00000613246 CD74P04233 296 aa16.5■□□□□ 0.23
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PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
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PTPRJ-207ENST00000613246 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
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PTPRJ-207ENST00000613246 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 C12orf54Q6X4T0 127 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 LINC01387J3KSC0 135 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 MMP9P14780 707 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 MYOGP15173 224 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 DLX6P56179 175 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR38Q5JTN6 314 aa16.47■□□□□ 0.23
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