RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578995.5

SMARCE1-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCE1, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-215ENST00000578995 CCL3L1P16619 93 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SERPINA2P20848 420 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 GLIPR1P48060 266 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 NPY4RP50391 375 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 BMXP51813 675 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 P2RX3P56373 397 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SCAND1P57086 179 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 VBP1P61758 197 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 LSM3P62310 102 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 GNB2P62879 340 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 RAB11BQ15907 218 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 TAF9Q16594 264 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 ESCO2Q56NI9 601 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 LCE1EQ5T753 118 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 HES5Q5TA89 166 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 GPR107Q5VW38 600 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 TMEM200BQ69YZ2 307 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 AWAT2Q6E213 333 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 BTN2A1Q7KYR7 527 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 LINC00596Q86U02 117 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 CHST4Q8NCG5 386 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 ST8SIA4Q92187 359 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 CORO2AQ92828 525 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 FAM46BQ96A09 425 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 PTX4Q96A99 478 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 MED30Q96HR3 178 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 KCTD7Q96MP8 289 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 OR8B2Q96RD0 313 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 CHST6Q9GZX3 395 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 METTL9Q9H1A3 318 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 PPA2Q9H2U2 334 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 CKLFQ9UBR5 152 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 CLN8Q9UBY8 286 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SSR3Q9UNL2 185 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 TNCP24821 2201 aa3.09□□□□□ -1.91
SMARCE1-215ENST00000578995 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ATRQ13535 2644 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 A0A087X0M5 115 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 A0A1B0GX30 115 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ODAMA1E959 279 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ODF3BA8MYP8 253 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 INAFM1C9JVW0 142 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 J3QLI3 93 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 M0R1W7 72 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 PDCD5O14737 125 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 SH2D1BO14796 132 aa3.08□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 MAGEB3O15480 346 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms