RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 HIST3H2BBQ8N257 126 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 HAVCR1Q96D42 359 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 F8VVB4 439 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 F8VWA3 439 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 PPP1R2P9O14990 202 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 TMEM42Q69YG0 159 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 NPRL2Q8WTW4 380 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 GPR173Q9NS66 373 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 POLEQ07864 2286 aa15.17■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR2AT4A6NND4 320 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 DVL1O14640 695 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 EFNB2P52799 333 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 MST1LQ2TV78 715 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 PCSK4Q6UW60 755 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 HEPN1Q6WQI6 88 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 POFUT1Q9H488 388 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 AUNIPQ9H7T9 357 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 CDH20Q9HBT6 801 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 SLC25A15Q9Y619 301 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 KISS1Q15726 138 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 DMRTA1Q5VZB9 504 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 C11orf87Q6NUJ2 197 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 MRGPRGQ86SM5 289 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR5L1Q8NGL2 311 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 GALNT14Q96FL9 552 aa15.16■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 J3QW42 95 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 RHEBQ15382 184 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 KHDC3LQ587J8 217 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 IZUMO1Q8IYV9 350 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM24BQ8N5W8 94 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 DNAJB11Q9UBS4 358 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM157AC9JC47 383 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 NXPH2O95156 264 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 NRASP01111 189 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 IGLV1-44P01699 117 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 RLN1P04808 185 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 IL2RGP31785 369 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM27E3Q08E93 113 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 C11orf88Q6PI97 169 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 ACBD4Q8NC06 268 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 PIGTQ969N2 578 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 GPER1Q99527 375 aa15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
GDE1-203ENST00000564172 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 ACACBO00763 2458 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 SMPD2O60906 423 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 FBXO24O75426 580 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 FAM157CP0CG43 387 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 GABRR1P24046 479 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 CDK2P24941 298 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 OR3A4PP47883 348 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 ACTBL2Q562R1 376 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 AWAT2Q6E213 333 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 BIVMQ86UB2 503 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 PIGCQ92535 297 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 RND1Q92730 232 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 SPSB1Q96BD6 273 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 SMIM8Q96KF7 97 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 YPEL4Q96NS1 127 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.14■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 CDC14BO60729 498 aa15.13■□□□□ 0.01
GDE1-203ENST00000564172 CTAG2O75638 210 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms