RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ID3	Q02535	119 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	RHEB	Q15382	184 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559		M0R036	132 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF44	P15621	663 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PTAFR	P25105	342 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEA5	P43359	124 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CLINT1	Q14677	625 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TSC22D1	Q15714	1073 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		15.75	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FAM166B	A8MTA8	275 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf172	C9J069	976 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V0C	P27449	155 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	GNG3	P63215	75 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZXDA	P98168	799 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SHE	Q5VZ18	495 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	LHX6	Q9UPM6	363 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	WRB	O00258	174 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B6	O14756	317 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	NGF	P01138	241 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	APLNR	P35414	380 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR8G1	Q15617	311 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		15.74	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PROB1	E7EW31	1015 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HSPB6	O14558	160 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SYNGR1	O43759	233 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PLGLB1	Q02325	96 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IL24	Q13007	206 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF10	Q5QP82	559 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PKIB	Q9C010	78 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	LRP5L	A4QPB2	252 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A6	P12236	298 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	F2R	P25116	425 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA3	P26006	1051 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF561	Q8N587	486 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HES7	Q9BYE0	225 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IFT22	Q9H7X7	185 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	COA4	Q9NYJ1	87 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		15.73	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OMG	P23515	440 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ASCL1	P50553	236 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CLN3	Q13286	438 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PCSK4	Q6UW60	755 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		15.72	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	WNT2	P09544	360 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1C3	P42330	323 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DRB3	P79483	266 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP82	Q8N141	532 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	C12orf57	Q99622	126 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	15.71	■□□□□ 0.11

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