RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	TIRAP	P58753	221 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CBX1	P83916	185 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	PITPNA	Q00169	270 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	AGK	Q53H12	422 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076		Q6ZTC4	211 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	LINC00471	Q8N535	108 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076		Q8N6K4	173 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2T4	Q8NH00	348 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OR9G1	Q8NH87	305 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	PGAM5	Q96HS1	289 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	TPD52L3	Q96J77	140 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	SH3GL1	Q99961	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	NIPAL2	Q9H841	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	GLS2	Q9UI32	602 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076		A0A0U1RQV5	110 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	FUOM	A2VDF0	154 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	ACOD1	A6NK06	481 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM183A	A6NL82	134 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076		J3QR06	171 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	NDUFB8	O95169	186 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	NRAS	P01111	189 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	SPARC	P09486	303 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CGB3	P0DN86	165 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CGB7	P0DN87	165 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC6A6	P31641	620 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	PYCR1	P32322	319 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	BLVRA	P53004	296 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	TCTA	P57738	103 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CDC42	P60953	191 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	RAB40B	Q12829	278 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	IL24	Q13007	206 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	MADCAM1	Q13477	382 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	EDDM3A	Q14507	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	GRK1	Q15835	563 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	MOB3C	Q70IA8	216 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CPO	Q8IVL8	374 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	TOMM40L	Q969M1	308 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	S1PR3	Q99500	378 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	ABHD6	Q9BV23	337 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	IFT27	Q9BW83	186 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076		G3V318	75 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	DLGAP1	O14490	977 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	CDK2AP2	O75956	126 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	MOS	P00540	346 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	NPPA	P01160	153 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SCFD1-223	ENST00000557076	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84

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