RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549076.1

ARFGAP1-222, Transcript of ADP ribosylation factor GTPase activating protein 1, human

TSL 2

Gene ARFGAP1, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GTF2F2	P13984	249 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SERPINA2	P20848	420 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MMP28	Q9H239	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TG	P01266	2768 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076		M0QZK8	103 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GPX5	O75715	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR2F2	O95006	317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LALBA	P00709	142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CGB3	P0DN86	165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CGB7	P0DN87	165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GZMH	P20718	246 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CD24	P25063	80 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MPV17L	Q2QL34	196 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	THRSP	Q92748	146 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076		J3QR06	171 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CD28	P10747	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LTC4S	Q16873	150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ORAI1	Q96D31	301 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	XPNPEP2	O43895	674 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	GNAO1	P09471	354 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CEL	P19835	753 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	FST	P19883	344 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	WNT4	P56705	351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076		Q6ZS46	218 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	R3HDM4	Q96D70	268 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR14A2	Q96R54	314 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RAB9B	Q9NP90	201 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076		A0A1W2PPK0	400 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RAB7A	P51149	207 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	LEAP2	Q969E1	77 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MUL1	Q969V5	352 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	MAS1	P04201	325 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	CD1A	P06126	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARFGAP1-222	ENST00000549076	SSTR5	P35346	364 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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