RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 KIR2DS4P43632 304 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 PAX9P55771 341 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SPCS3P61009 180 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 RAB11AP62491 216 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SERF2P84101 59 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 RUNX1Q01196 453 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 KIR2DS1Q14954 304 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 Q6ZPA2 131 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SYT13Q7L8C5 426 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SAXO1Q8IYX7 474 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 Q9N2K0 584 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 GNG13Q9P2W3 67 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 VAX2Q9UIW0 290 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CA14Q9ULX7 337 aa9.08□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 FAM221AA4D161 298 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 LRP5LA4QPB2 252 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CHST1O43916 411 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SELLP14151 372 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZNF154Q13106 437 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SSX2Q16385 188 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ACY3Q96HD9 319 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 RASL10BQ96S79 203 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SSX3Q99909 188 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 NDUFAF3Q9BU61 184 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 GPR87Q9BY21 358 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 NAT8Q9UHE5 227 aa9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 EPOPA6NHQ4 379 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 NAPSAO96009 420 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 LCATP04180 440 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 RNF224P0DH78 156 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 PGA5P0DJD9 388 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 MPV17LQ2QL34 196 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 OR1P1Q8NH06 330 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 EXTL1Q92935 676 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 LRFN1Q9P244 771 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SLC22A20A6NK97 555 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 A8MWP6 167 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 PDLIM4P50479 330 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZNF92Q03936 586 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZNF124Q15973 351 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 PLCXD3Q63HM9 321 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 GAPTQ8N292 157 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 OR4X1Q8NH49 305 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SPSB4Q96A44 273 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 RPRMQ9NS64 109 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 SEC16AO15027 2179 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 GJE1A6NN92 205 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 AMBPP02760 352 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 PCBD1P61457 104 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 HNF4GQ14541 408 aa9.05□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
CS-202ENST00000542324 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.6 ms