RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 C5orf51A6NDU8 294 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TMEM210A6NLX4 147 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 C3orf80F5H4A9 247 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 J3QT63 122 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PRAF2O60831 178 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 IGHV3-13P01766 116 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MPZP25189 248 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ACTBP60709 375 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ACTG1P63261 375 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TLE1Q04724 770 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 IL24Q13007 206 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CDSNQ15517 529 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PIGYQ3MUY2 71 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZR03 302 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 WDR86Q86TI4 376 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 LRP11Q86VZ4 500 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MFNGO00587 321 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CSF1P09603 554 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ADCYAP1P18509 176 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CEBPGP53567 150 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SELENOVP59797 346 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF154Q13106 437 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ARL6IP1Q15041 203 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 Q8NFD4 153 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RHOVQ96L33 236 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SYT3Q9BQG1 590 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PRR13Q9NZ81 148 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 AMY2AP04746 511 aa7.37□□□□□ -1.23
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THBS3-210ENST00000541576 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PDCD1Q15116 288 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 C4orf17Q53FE4 359 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PECRQ9BY49 303 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NPTNQ9Y639 398 aa7.37□□□□□ -1.23
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THBS3-210ENST00000541576 RHBDL1O75783 438 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GRPP07492 148 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FGF12P61328 243 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.37□□□□□ -1.23
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THBS3-210ENST00000541576 LINC01560Q8TB33 94 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ZNF488Q96MN9 340 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.37□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 A0A1B0GWJ7 208 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 M0R036 132 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CDIPTO14735 213 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 NDUFB6O95139 128 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 AKR1C4P17516 323 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MZT1Q08AG7 82 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ARFRP1Q13795 201 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PEA15Q15121 130 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 POM121Q96HA1 1249 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FBXO24O75426 580 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 TAS2R19P59542 299 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 RAB5BP61020 215 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 OR52W1Q6IF63 320 aa7.36□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 BRICD5Q6PL45 260 aa7.36□□□□□ -1.23
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