RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495082.5

SLC13A3-211, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-211ENST00000495082 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 SNAPC3Q92966 411 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 TIMD4Q96H15 378 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 MED30Q96HR3 178 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 MGST3O14880 152 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 NDUFS7O75251 213 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 DHFRP00374 187 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 TK1P04183 234 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 AKAIN1P0CW23 69 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 FAUP35544 74 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 RAG2P55895 527 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 GRK1Q15835 563 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ACTBL2Q562R1 376 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 STEAP1BQ6NZ63 245 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 RAB1CQ92928 201 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 MARVELD3Q96A59 401 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 COQ2Q96H96 371 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 CCL13Q99616 98 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 Q9N2K0 584 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 USF3Q68DE3 2245 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 IGHV4-39P01824 125 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 CD3DP04234 171 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 TAS2R46P59540 309 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF787Q6DD87 383 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 OR52W1Q6IF63 320 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 OR56B4Q8NH76 319 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC13A3-211ENST00000495082 MCUBQ9NWR8 336 aa9.59□□□□□ -0.87
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SLC13A3-211ENST00000495082 MGAT4AQ9UM21 535 aa9.59□□□□□ -0.87
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SLC13A3-211ENST00000495082 A0A0A6YYJ9 748 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 C7orf66A4D0T2 115 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 TMPRSS2O15393 492 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 RAB3DO95716 219 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 FCER2P06734 321 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 KIR2DS4P43632 304 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 MEF2DQ14814 521 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 KIR2DS1Q14954 304 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 OR4K15Q8NH41 348 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 LIME1Q9H400 295 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 A0A1B0GW55 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 ADAM20O43506 726 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 HRH1P35367 487 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 P2RX3P56373 397 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 AESQ08117 197 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 GHITMQ9H3K2 345 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 DUX4Q9UBX2 424 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 KIF25Q9UIL4 384 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 ZNF221Q9UK13 617 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 PTPN13Q12923 2485 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 TRDCB7Z8K6 153 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 SELLP14151 372 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 CR1LQ2VPA4 569 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 SPICQ8N5J4 248 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.57□□□□□ -0.88
SLC13A3-211ENST00000495082 GSX2Q9BZM3 304 aa9.57□□□□□ -0.88
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