RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 ZNF175Q9Y473 711 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 LNP1A1A4G5 178 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 ZNF724A8MTY0 619 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 APLNRP35414 380 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 IGFBP7Q16270 282 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 GPR87Q9BY21 358 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 SMCO4Q9NRQ5 59 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 R4GN57 208 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 FAM186AA6NE01 2351 aa14.48□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 MEOX1P50221 254 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 COMMD1Q8N668 190 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 C14orf79Q96F83 325 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 CLCC1Q96S66 551 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 PRSS44E7EML9 344 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 SLC34A2O95436 690 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 WNT5AP41221 380 aa14.47□□□□□ -0.09
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ACTB-207ENST00000462494 HMGN3Q15651 99 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 IL17BQ9UHF5 180 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 MED13Q9UHV7 2174 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 COLCA2A8K830 154 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 C21orf140B9A014 251 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 CST7O76096 145 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 ZNF883P0CG24 379 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 CA6P23280 308 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 OR2T2Q6IF00 324 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 DEFB123Q8N688 67 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 LIPGQ9Y5X9 500 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 KNTC1P50748 2209 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-207ENST00000462494 TUSC2O75896 110 aa14.46□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 CTXN2P0C2S0 81 aa14.46□□□□□ -0.1
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ACTB-207ENST00000462494 CLN3Q13286 438 aa14.46□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 ZNF266Q14584 549 aa14.46□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 AWAT1Q58HT5 328 aa14.46□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 SCRT1Q9BWW7 348 aa14.46□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.46□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 GPR37O15354 613 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 RHBDL1O75783 438 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 SP1P08047 785 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 ATP6V0CP27449 155 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 UCP2P55851 309 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 ZNF573Q86YE8 665 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 FAM58AQ8N1B3 248 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 BIN3Q9NQY0 253 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 TRAV24A0A0B4J272 114 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 PROB1E7EW31 1015 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 WRBO00258 174 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 PITX3O75364 302 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 EPHA1P21709 976 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 VDAC1P21796 283 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 UCP1P25874 307 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 GNG3P63215 75 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 NMSQ5H8A3 153 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 OR51H1Q8NH63 302 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 PLK3Q9H4B4 646 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 GLRX2Q9NS18 164 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-207ENST00000462494 NCOR1O75376 2440 aa14.44□□□□□ -0.1
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