RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 TRAM1Q15629 374 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CEACAM16Q2WEN9 425 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 COX19Q49B96 90 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC38Q502W7 563 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TIMM23BQ5SRD1 257 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 SSX9Q7RTT3 188 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 STEAP2Q8NFT2 490 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR2Z1Q8NG97 314 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 OR51G1Q8NGK1 321 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR10G6Q8NH81 332 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 NDNFQ8TB73 568 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 KCTD13Q8WZ19 329 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 GLYATL1Q969I3 302 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 APH1AQ96BI3 265 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 REEP6Q96HR9 211 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CPB2Q96IY4 423 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DRC1Q96MC2 740 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SLC38A2Q96QD8 506 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NUDT22Q9BRQ3 303 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC1Q9BTT6 524 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR10A5Q9H207 317 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 SLC7A7Q9UM01 511 aa-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 TIMM22Q9Y584 194 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 SNX13Q9Y5W8 968 aa-2.62□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 STK36Q9NRP7 1315 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TOP2BQ02880 1626 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TRAV18A0A075B6X5 111 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 G3V3G9 751 aa-2.63□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 SPDEFO95238 335 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6V1G2O95670 118 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MT-ND2P03891 347 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CLTBP09497 229 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CNPP09543 421 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 TPH1P17752 444 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 VCLP18206 1134 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 VDAC1P21796 283 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 COX7A1P24310 79 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 STOMP27105 288 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 HRH1P35367 487 aa-2.63□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 UGT2B10P36537 528 aa-2.63□□□□□ -2.83
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