RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.37
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PTPRU-204ENST00000428026 OR1K1Q8NGR3 316 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.76□□□□□ -0.37
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PTPRU-204ENST00000428026 OR1B1Q8NGR6 318 aa12.75□□□□□ -0.37
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PTPRU-204ENST00000428026 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SLC52A3Q9NQ40 469 aa12.74□□□□□ -0.37
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PTPRU-204ENST00000428026 IL11RAQ14626 422 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SLC35E4Q6ICL7 350 aa12.74□□□□□ -0.37
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PTPRU-204ENST00000428026 C3orf80F5H4A9 247 aa12.73□□□□□ -0.37
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PTPRU-204ENST00000428026 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
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PTPRU-204ENST00000428026 TRIP11Q15643 1979 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SPINT1O43278 529 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 VDAC1P21796 283 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 RUNX1Q01196 453 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SLC35E3Q7Z769 313 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 RFLNBQ8N5W9 214 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 OR8A1Q8NGG7 326 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 R3HDM4Q96D70 268 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SMIM12Q96EX1 92 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 GHITMQ9H3K2 345 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 CD99P14209 185 aa12.72□□□□□ -0.37
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