RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416108.5

RBM39-208, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 4

Gene RBM39, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-208ENST00000416108 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 PTPN13Q12923 2485 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 A0A1B0GW55 424 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 A0A1W2PPH5 198 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 hADV38S2A0JD32 116 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ODAMA1E959 279 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DISC1C4P0D8 188 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DVL1O14640 695 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ORC5O43913 435 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 SSX5O60225 188 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 NAPSAO96009 420 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 MT-ND4P03905 459 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 IFNA6P05013 189 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 AKAIN1P0CW23 69 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 SELLP14151 372 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TBPP20226 339 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 GLIPR1P48060 266 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 HLA-DRB3P79483 266 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 MEF2DQ14814 521 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.295e-7■□□□□ 10.8
RBM39-208ENST00000416108 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 HOGA1Q86XE5 327 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TRIM63Q969Q1 353 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 Q9N2K0 584 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 CTSZQ9UBR2 303 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DUX4Q9UBX2 424 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 KLK11Q9UBX7 282 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TRDCB7Z8K6 153 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 FABP7O15540 132 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 SPINT2O43291 252 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 RAB3DO95716 219 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 WNT2P09544 360 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 CTXN2P0C2S0 81 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 HLA-DMAP28067 261 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 IL2RGP31785 369 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 PAX5Q02548 391 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 Q5PR19 223 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 CD276Q5ZPR3 534 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 STEAP3Q658P3 488 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 OR52W1Q6IF63 320 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 TMEM17Q86X19 198 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 GAPTQ8N292 157 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 PRR18Q8N4B5 295 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 POC5Q8NA72 575 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 COQ2Q96H96 371 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 MCUBQ9NWR8 336 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 EHFQ9NZC4 300 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 SPG11Q96JI7 2443 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 CR1P17927 2039 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-208ENST00000416108 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.97□□□□□ -1.29
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