RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV3-11P04433 115 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 TRGC1P0CF51 173 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 RD3LP0DJH9 198 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF43P17038 809 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 OR1D4P47884 311 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SLC10A1Q14973 349 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 IQCJQ1A5X6 159 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 HAS2Q92819 552 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 TSLPQ969D9 159 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 GPR87Q9BY21 358 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 BANF2Q9H503 90 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 STARD5Q9NSY2 213 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 VAX2Q9UIW0 290 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 VDAC3Q9Y277 283 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 RP1P56715 2156 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS20P59510 1910 aa6.23□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GX78 115 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A18H0YCH9 400 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 H3BMH7 237 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 MPZL1O95297 269 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SOD3P08294 240 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 RNF224P0DH78 156 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SFTPCP11686 197 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 IL2RGP31785 369 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CD200P41217 278 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CLRN1P58418 232 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ERVFRD-1P60508 538 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 HERV-K104P61576 105 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 IL24Q13007 206 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 IL11RAQ14626 422 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 HAGHQ16775 308 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM18Q96B42 140 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SPSB1Q96BD6 273 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 R3HDM4Q96D70 268 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 RARRES3Q9UL19 164 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.22□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GU03 582 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 RAMP1O60894 148 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 DHRS3O75911 302 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 IFNA5P01569 189 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 TK1P04183 234 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CXCL1P09341 107 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 FREM3P0C091 2139 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V0CP27449 155 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 S100GP29377 79 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ICAM4Q14773 271 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf189Q5VU69 101 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 Q6ZSR3 168 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 UEVLDQ8IX04 471 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 OR1L3Q8NH93 324 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.21□□□□□ -1.41
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.21□□□□□ -1.41
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