RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 CACNA1DQ01668 2161 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFS8O00217 210 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NAPSAO96009 420 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 PMP2P02689 132 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 MT-ND4P03905 459 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CD3DP04234 171 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NAT1P18440 290 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ERP29P30040 261 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 GLP1RP43220 463 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 P2RX3P56373 397 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 DSCR9P59020 149 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TSPAN5P62079 268 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 CDK10Q15131 360 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF565Q8N9K5 539 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 GSX2Q9BZM3 304 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 SHARPINQ9H0F6 387 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 NARFLQ9H6Q4 476 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 HRASLSQ9HDD0 168 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 EHFQ9NZC4 300 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 ANXA10Q9UJ72 324 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRK-201ENST00000368202 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TRDCB7Z8K6 153 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 M0QYG6 137 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DVL1O14640 695 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PTTG1O95997 202 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 AMY2AP04746 511 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 HEXAP06865 529 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SELLP14151 372 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 HRH1P35367 487 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GLIPR1P48060 266 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 NPY4RP50391 375 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GNB2P62879 340 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 HLA-DRB3P79483 266 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM16LQ309B1 348 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PRR18Q8N4B5 295 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TPRX1Q8N7U7 411 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 MINDY2Q8NBR6 621 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR4C16Q8NGL9 310 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 COQ2Q96H96 371 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CYYR1Q96J86 154 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CLN8Q9UBY8 286 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TBC1D24Q9ULP9 559 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GW55 424 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PPH5 198 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 hADV38S2A0JD32 116 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ODAMA1E959 279 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GPR37O15354 613 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PLA2G10O15496 165 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 FABP7O15540 132 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SPINT2O43291 252 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CD74P04233 296 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CTXN2P0C2S0 81 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DUX4L2P0CJ85 424 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DUX4L3P0CJ86 424 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DUX4L4P0CJ87 422 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DUX4L5P0CJ88 424 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DUX4L6P0CJ89 424 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DUX4L7P0CJ90 424 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PAX1P15863 534 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GZMHP20718 246 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GIFP27352 417 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 IL2RGP31785 369 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PAX5Q02548 391 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ESCO2Q56NI9 601 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZS49 121 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 OR4A4PQ8NGN8 299 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 MRGPRDQ8TDS7 321 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 SNAPC3Q92966 411 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 RAB39BQ96DA2 213 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 LURAP1Q96LR2 239 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PRRT1Q99946 306 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 GINS4Q9BRT9 223 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 CTSZQ9UBR2 303 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 DUX4Q9UBX2 424 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV39A0A0B4J263 110 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRK-201ENST00000368202 BET1O15155 118 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms