RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 OPN5Q6U736 354 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM64Q6YI46 380 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PAQR9Q6ZVX9 377 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CEACAM19Q7Z692 300 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF101Q8IZC7 436 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM99Q8N816 258 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 FRMD1Q8N878 549 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 NAXEQ8NCW5 288 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR13C4Q8NGS5 318 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR13C2Q8NGS9 318 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR4S2Q8NH73 311 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM234Q8WY98 164 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf40Q8WZ69 217 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 AQP3Q92482 292 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 DYRK2Q92630 601 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SMARCD2Q92925 531 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TSLPQ969D9 159 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PTX4Q96A99 478 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM159Q96B96 161 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RAB39BQ96DA2 213 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SEH1LQ96EE3 360 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PRRC1Q96M27 445 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TSSK3Q96PN8 268 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 DERL3Q96Q80 235 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR8B4Q96RC9 309 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TP53RKQ96S44 253 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 GINS3Q9BRX5 216 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SLC39A8Q9C0K1 460 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SPATC1LQ9H0A9 340 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SLITRK2Q9H156 845 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PLK3Q9H4B4 646 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 BCL2L10Q9HD36 194 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PXMP2Q9NR77 195 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF581Q9P0T4 197 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 B4GALT7Q9UBV7 327 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 IL36AQ9UHA7 158 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 HSF4Q9ULV5 492 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 FUT9Q9Y231 359 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ANGPT4Q9Y264 503 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 GTF3C1Q12789 2109 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PPIAL4EA0A075B759 164 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WUU8 490 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0G2JN53 185 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM235A6NFC5 223 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR4C45A6NMZ5 311 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 YJEFN3A6XGL0 299 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 FTCDNL1E5RQL4 147 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PPIAL4DF5H284 164 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 F5H5T6 163 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 H3BN98 237 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 H3BQ15 152 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 J3KRW8 73 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 K7EPK0 472 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CCL22O00626 93 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CYB5BO43169 146 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 NME6O75414 186 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SEMA4FO95754 770 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 STAG3L3P0CL85 134 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CT45A8P0DMV1 189 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CT45A9P0DMV2 189 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PPIAL4FP0DN26 164 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PPIAL4GP0DN37 164 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 OR13C7P0DN81 318 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CXCL8P10145 99 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ALPPL2P10696 532 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 SPTBP11277 2137 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 COX7A2P14406 83 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 IL9P15248 144 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ADRA2CP18825 462 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 GDF1P27539 372 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 GPR4P46093 362 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 RPL29P47914 159 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-202ENST00000367364 PRRX1P54821 245 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.6 ms