RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 GPR132Q9UNW8 380 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 A8MXE2 369 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TMPRSS2O15393 492 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 FGL1Q08830 312 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 RAB32Q13637 225 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ANKRD55Q3KP44 614 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PSMB6P28072 239 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 COL10A1Q03692 680 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 BSPH1Q075Z2 132 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SPSB4Q96A44 273 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TM2D1Q9BX74 207 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 GON7Q9BXV9 100 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ATPIF1Q9UII2 106 aa9.88□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 AGPAT2O15120 278 aa9.87□□□□□ -0.83
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HPS1-204ENST00000361490 SFT2D2O95562 160 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PRH1P02810 166 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 OR4A8P0C604 315 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 GLIPR1P48060 266 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TMEM42Q69YG0 159 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 LYPD6Q86Y78 171 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 OR1S1Q8NH92 325 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 LEAP2Q969E1 77 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PROB1E7EW31 1015 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 IGLV3-1P01715 115 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SELLP14151 372 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ZBTB25P24278 435 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CD40P25942 277 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CLINT1Q14677 625 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 OR51I2Q9H344 312 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MLNRO43193 412 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 UCNP55089 124 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 RPS23P62266 143 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TLE1Q04724 770 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 GNMTQ14749 295 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PPP1R35Q8TAP8 253 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 LRRK2Q5S007 2527 aa9.87□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.86□□□□□ -0.83
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HPS1-204ENST00000361490 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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HPS1-204ENST00000361490 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 OR1L1Q8NH94 360 aa9.86□□□□□ -0.83
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HPS1-204ENST00000361490 MED30Q96HR3 178 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CCL13Q99616 98 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa9.86□□□□□ -0.83
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HPS1-204ENST00000361490 GNG10P50151 68 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CEBPGP53567 150 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MPV17LQ2QL34 196 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MITD1Q8WV92 249 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 GALMQ96C23 342 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 OR10C1Q96KK4 312 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PSG11Q9UQ72 335 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 RELNP78509 3460 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TRDCB7Z8K6 153 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 H3BUI4 141 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 GYPAP02724 150 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 WDR86Q86TI4 376 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 LGI3Q8N145 548 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 ZNF75AQ96N20 296 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 METRNQ9UJH8 293 aa9.86□□□□□ -0.83
HPS1-204ENST00000361490 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
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