RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 PPIHO43447 177 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 CA11O75493 328 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 ARL16Q0P5N6 197 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 VAX1Q5SQQ9 334 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 ZNF320A2RRD8 509 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 NPIPB9F8W1W9 429 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 TMPRSS2O15393 492 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 ZNHIT1O43257 154 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 TMEM229AB2RXF0 380 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 PRR27Q6MZM9 219 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 LINC00596Q86U02 117 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OR4A4PQ8NGN8 299 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OR4S2Q8NH73 311 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 R3HDM4Q96D70 268 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 LINC00052Q96N35 136 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC13O75165 2243 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 G3V3Q6 166 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 GZMHP20718 246 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 APCDD1LQ8NCL9 501 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 SLC25A22Q9H936 323 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OPN1MWP04001 364 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OPRK1P41145 380 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 ATP6V1FQ16864 119 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 DCAF12L2Q5VW00 463 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 TMEM210A6NLX4 147 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 NKX2-8O15522 239 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 CDS2O95674 445 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 CD3EP07766 207 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 FTH1P19P0C7X4 201 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 G6PC2Q9NQR9 355 aa18.04■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 CEACAM21Q3KPI0 293 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 BVESQ8NE79 360 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 RNF7Q9UBF6 113 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 COX7A1P24310 79 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 FABP9Q0Z7S8 132 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 ZNF154Q13106 437 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 SIGIRRQ6IA17 410 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 SLC23A3Q6PIS1 610 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 FKBP11Q9NYL4 201 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 CNN1P51911 297 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OR10G4Q8NGN3 311 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OR10G9Q8NGN4 311 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OR10G7Q8NGN6 311 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 RND1Q92730 232 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 MRGPRFQ96AM1 343 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 OR5H1A6NKK0 313 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 IGHMP01871 453 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 ATP5SQ99766 215 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 HES7Q9BYE0 225 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 RNF122Q9H9V4 155 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 H0Y8G0 127 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 SP9P0CG40 484 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 TXN2Q99757 166 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 SLC35D1Q9NTN3 355 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 TNFSF18Q9UNG2 199 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 MS4A3Q96HJ5 214 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-201ENST00000345716 SHISA3A0PJX4 238 aa18.02■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 CHEK1O14757 476 aa18.02■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.02■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 FDX2Q6P4F2 183 aa18.02■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 CTDSP1Q9GZU7 261 aa18.02■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 ZNF737O75373 536 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 ZNF250P15622 560 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 CTRB1P17538 263 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 CTRB2Q6GPI1 263 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 MISP3Q96FF7 219 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 SRXN1Q9BYN0 137 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 AESQ08117 197 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 TGIF1Q15583 401 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 SNAI3Q3KNW1 292 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 SAP30LQ9HAJ7 183 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 POMT1Q9Y6A1 747 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 MOB3AQ96BX8 217 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 MMP24Q9Y5R2 645 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 PRSS50Q9UI38 385 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 RECKO95980 971 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 ERVFC1-1P60608 527 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 TMEM218A2RU14 115 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 LINC00862A6NCI5 91 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 ZNF345Q14585 488 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 DTD1Q8TEA8 209 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 LPAR3Q9UBY5 353 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-201ENST00000345716 CDRT15L2A8MXV6 281 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms