RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 EGR1P18146 543 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 PTAFRP25105 342 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 LMO1P25800 156 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 CASP6P55212 293 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SMIM21Q3B7S5 101 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM65Q6PI78 240 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 NUP37Q8NFH4 326 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 PRR7Q8TB68 274 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 MFFQ9GZY8 342 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.49□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 DPRXA6NFQ7 191 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 MPTX1A8MV57 137 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 PSPNO60542 156 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 TFF1P04155 84 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 OR5AC1P0C628 307 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 S100A11P31949 105 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 HTR2BP41595 481 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 CYCSP99999 105 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM187Q14656 261 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SP6Q3SY56 376 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SPRNQ5BIV9 151 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 PCSK4Q6UW60 755 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF546Q86UE3 836 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF565Q8N9K5 539 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF680Q8NEM1 530 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 OR10Z1Q8NGY1 313 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SECTM1Q8WVN6 248 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 GALNT14Q96FL9 552 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 KIRREL1Q96J84 757 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 OR10C1Q96KK4 312 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 OR2V2Q96R30 315 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SLC5A7Q9GZV3 580 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHB10Q9UN67 800 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 CA7P43166 264 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ID4P47928 161 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 KCNJ3P48549 501 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SELENOVP59797 346 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SSX8Q7RTT4 187 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 THAP6Q8TBB0 222 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ITLN1Q8WWA0 313 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 C2orf50Q96LR7 162 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SUCNR1Q9BXA5 334 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ARL6Q9H0F7 186 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 MBD2Q9UBB5 411 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 WIPI2Q9Y4P8 454 aa10.48□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ABCD4O14678 606 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 PSMB6P28072 239 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 GNRHRP30968 328 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 HMGN3Q15651 99 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 MOGAT3Q86VF5 341 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 FAM185AQ8N0U4 392 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 LILRB4Q8NHJ6 448 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 METRNQ9UJH8 293 aa10.47□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SRRM5B3KS81 715 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 IFNL4K9M1U5 179 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 GPR31O00270 319 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 CFDP00746 253 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 OR3A1P47881 315 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 RND3P61587 244 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 COL10A1Q03692 680 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 BSPH1Q075Z2 132 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 SLC35E4Q6ICL7 350 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 LIAT1Q6ZQX7 453 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 OR1A1Q9P1Q5 309 aa10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
ZNF548-201ENST00000336128 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 HSD17B6O14756 317 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 MPPED1O15442 326 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 RP2O75695 350 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 IFNA7P01567 189 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 IFNA21P01568 189 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV1-46P01743 117 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 CFHR2P36980 270 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 ASCL1P50553 236 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.46□□□□□ -0.74
ZNF548-201ENST00000336128 LDLRAD3Q86YD5 345 aa10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms