RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 DVL1O14640 695 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLIPR1P48060 266 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 P2RX3P56373 397 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFITM3Q01628 133 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAX5Q02548 391 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM229BQ8NBD8 167 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 BPESC1Q9GZL8 116 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q9N2K0 584 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTSZQ9UBR2 303 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-DMAP28067 261 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERP29P30040 261 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52W1Q6IF63 320 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAPTQ8N292 157 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPRX1Q8N7U7 411 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 NINJ1Q92982 152 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNIP1Q9NZI2 227 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANAPC10Q9UM13 185 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPXA8MT69 81 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAT1P18440 290 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAUP35544 74 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARPC4P59998 168 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHRFAM7AQ494W8 412 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf105Q8TEF2 133 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CELSR2Q9HCU4 2923 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPG11Q96JI7 2443 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ODAMA1E959 279 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR2DS4P43632 304 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R46P59540 309 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR2DS1Q14954 304 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBD6Q96DN6 1003 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 LURAP1Q96LR2 239 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR6C3Q9NZP0 311 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT2P09544 360 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKAIN1P0CW23 69 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBPP20226 339 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR3A3P47888 321 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 DYRK1AQ13627 763 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTBL2Q562R1 376 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf183Q5T699 404 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 STEAP1BQ6NZ63 245 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF565Q8N9K5 539 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEDD2Q8WXF8 326 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNAPC3Q92966 411 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLN8Q9UBY8 286 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANXA10Q9UJ72 324 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBN2P35556 2912 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRDCB7Z8K6 153 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR37O15354 613 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD3DP04234 171 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLP1RP43220 463 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPY4RP50391 375 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC12BQ2HXU8 276 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF880Q6PDB4 577 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 POC5Q8NA72 575 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5H2Q8NGV7 314 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPN13Q12923 2485 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV39A0A0B4J263 110 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB3DO95716 219 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MZT2BQ6NZ67 158 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAT1Q6PIZ9 186 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZS49 121 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPEQ02224 2701 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 hADV38S2A0JD32 116 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNB2P62879 340 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL31P62899 125 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASAH1Q13510 395 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 ESCO2Q56NI9 601 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGFRL1Q8N441 504 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5AP2Q8NGF4 316 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRGPRDQ8TDS7 321 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCUBQ9NWR8 336 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 TACC2O95359 2948 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 PMP2P02689 132 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNA6P05013 189 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 GZMHP20718 246 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 HRH1P35367 487 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-DRB3P79483 266 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEF2DQ14814 521 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZPA2 131 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB39BQ96DA2 213 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 HRASLSQ9HDD0 168 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D24Q9ULP9 559 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 FABP7O15540 132 aa22.73■■□□□ 1.23
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