RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 WNT9BO14905 357 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD8-201ENST00000313173 ACP7Q6ZNF0 438 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD8-201ENST00000313173 TMUB2Q71RG4 321 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD8-201ENST00000313173 GAPTQ8N292 157 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD8-201ENST00000313173 OR4A4PQ8NGN8 299 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD8-201ENST00000313173 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXD8-201ENST00000313173 TUSC2O75896 110 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 S100A11P31949 105 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF680Q8NEM1 530 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 GALNT14Q96FL9 552 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 RDH8Q9NYR8 311 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PHLDA2Q53GA4 152 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 VHLLQ6RSH7 139 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF546Q86UE3 836 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 C17orf50Q8WW18 174 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 RND1Q92730 232 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 DMRTA2Q96SC8 542 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 VKORC1Q9BQB6 163 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 SYT3Q9BQG1 590 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 CABLES2Q9BTV7 478 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 MFFQ9GZY8 342 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 OR14J1Q9UGF5 321 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 LMO1P25800 156 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 KLRB1Q12918 225 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 SSX8Q7RTT4 187 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHB10Q9UN67 800 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ITPR1Q14643 2758 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM108Q6UXF1 575 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 CADP27708 2225 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 HTR2BP41595 481 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM21Q3B7S5 101 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PCSK4Q6UW60 755 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PRR7Q8TB68 274 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ARL6Q9H0F7 186 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 TAAR3PQ9P1P4 343 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PSMB6P28072 239 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 KCNJ3P48549 501 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 FAM185AQ8N0U4 392 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 NUP37Q8NFH4 326 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 THAP6Q8TBB0 222 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC29Q8WV35 223 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf50Q96LR7 162 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 SUCNR1Q9BXA5 334 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 TNFSF18Q9UNG2 199 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 IFNA7P01567 189 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 HOXB5P09067 269 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 OR5AC1P0C628 307 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PTAFRP25105 342 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM187Q14656 261 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 WFDC8Q8IUA0 241 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 OR11L1Q8NGX0 322 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 OR10Z1Q8NGY1 313 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ATRXP46100 2492 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 SPTA1P02549 2419 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 MPTX1A8MV57 137 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF565Q8N9K5 539 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 OR10C1Q96KK4 312 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 WIPI2Q9Y4P8 454 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PSPNO60542 156 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 GNRHRP30968 328 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 SELENOVP59797 346 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 MEMO1Q9Y316 297 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 NBEAQ8NFP9 2946 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 RP2O75695 350 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 THBDP07204 575 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 RND3P61587 244 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 LY6DQ14210 128 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF345Q14585 488 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 OR10J5Q8NHC4 309 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 SECTM1Q8WVN6 248 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 KIRREL1Q96J84 757 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 MEGF10Q96KG7 1140 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 MBD2Q9UBB5 411 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXD8-201ENST00000313173 PKD1L2Q7Z442 2459 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD8-201ENST00000313173 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0D9SG52 128 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD8-201ENST00000313173 IFNL4K9M1U5 179 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1-13P0DP09 117 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXD8-201ENST00000313173 CFHR2P36980 270 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms