RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TDRG1Q3Y452 100 aa12.77□□□□□ -0.36
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF774Q6NX45 483 aa12.77□□□□□ -0.36
CCNDBP1-201ENST00000300213 LYPD6Q86Y78 171 aa12.77□□□□□ -0.36
CCNDBP1-201ENST00000300213 BEND2Q8NDZ0 799 aa12.77□□□□□ -0.36
CCNDBP1-201ENST00000300213 SDF2L1Q9HCN8 221 aa12.77□□□□□ -0.36
CCNDBP1-201ENST00000300213 SVILO95425 2214 aa12.77□□□□□ -0.36
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANKUB1A6NFN9 424 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRYAAP02489 173 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 GZMHP20718 246 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAB4Q2WGN9 574 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 FNDC7Q5VTL7 733 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAPTQ8N292 157 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 METTL7AQ9H8H3 244 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC7A10Q9NS82 523 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 PITX3O75364 302 aa12.77□□□□□ -0.37
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CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM90A2PQ658T7 463 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM204Q9BSN7 226 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 VAMP8Q9BV40 100 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARV1Q9H2C2 271 aa12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD82P27701 267 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNN1P51911 297 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TGFBR3Q03167 851 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf40Q8IXQ3 194 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CARFQ8N187 725 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TBX21Q9UL17 535 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ALG1L2C9J202 215 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPYP01298 95 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 NTSR1P30989 418 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 HIST1H3AP68431 136 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCF23Q7RTU1 214 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 GATAD1Q8WUU5 269 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 EXTL1Q92935 676 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNS2Q9ULS6 477 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRG2CA6NGY1 282 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEACAM18A8MTB9 384 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNFRSF10CO14798 259 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM50AO95807 157 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TAS2R30P59541 319 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 G3V3Y1 287 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF17P17021 662 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMB3P49720 205 aa12.75□□□□□ -0.37
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 C20orf202A1L168 122 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 LMO1P25800 156 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR10J1P30954 320 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAS1LP35410 378 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 EFNA3P52797 238 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAT8Q9UHE5 227 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRYLO94915 3013 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CD300LBA8K4G0 201 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0R135 149 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 SERPINA7P05543 415 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 COL9A1P20849 921 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 DCAF7P61962 342 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 THEM4Q5T1C6 240 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNIP4Q6PIL6 250 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF799Q96GE5 643 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 IMMP2LQ96T52 175 aa12.75□□□□□ -0.37
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CCNDBP1-201ENST00000300213 HSPB9Q9BQS6 159 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CUTCQ9NTM9 273 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 VAX2Q9UIW0 290 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa12.75□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRDCB7Z8K6 153 aa12.74□□□□□ -0.37
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV39A0A0B4J263 110 aa12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa12.74□□□□□ -0.37
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPPL3Q8TCT6 385 aa12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLCXD3Q63HM9 321 aa12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CMTM2Q8TAZ6 248 aa12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CCNDBP1-201ENST00000300213 DOCK7Q96N67 2140 aa12.74□□□□□ -0.37
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