RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 PSPNO60542 156 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 MELTFP08582 738 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 GNB3P16520 340 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 IL18Q14116 193 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 CDNFQ49AH0 187 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 ZNF561Q8N587 486 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 CYYR1Q96J86 154 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 TSC22D3Q99576 134 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 CCL13Q99616 98 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 MIOXQ9UGB7 285 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 NKX6-3A6NJ46 265 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 CA11O75493 328 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 VENTXO95231 258 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 IL13RA1P78552 427 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 PITPNAQ00169 270 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 MADCAM1Q13477 382 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 ZNF79Q15937 498 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 BRICD5Q6PL45 260 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 NANPQ8TBE9 248 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 MED30Q96HR3 178 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 SNX22Q96L94 193 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 INSIG2Q9Y5U4 225 aa15.09■□□□□ 0.01
PTX4-201ENST00000293922 A0A0A6YYJ9 748 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 TMEM235A6NFC5 223 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 K7N7A8 449 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 CTDSPLO15194 276 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 CSN2P05814 226 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 OR3A1P47881 315 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 KCNJ3P48549 501 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 PAX2Q02962 417 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 HACD4Q5VWC8 232 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 ZNRF1Q8ND25 227 aa15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 A0A1B0GW55 424 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 HSPB6O14558 160 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 TMPRSS2O15393 492 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 ADAM20O43506 726 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 PAX5Q02548 391 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 LYPD2Q6UXB3 125 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 OR8H2Q8N162 312 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 FAM216BQ8N7L0 139 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 OR4S1Q8NGB4 309 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R35Q8TAP8 253 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 SRRQ9GZT4 340 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 PPA2Q9H2U2 334 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 CTSZQ9UBR2 303 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 DUX4Q9UBX2 424 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 AK3Q9UIJ7 227 aa15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 UBE2QL1A1L167 161 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 TK1P04183 234 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 PTHLHP12272 177 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 SELLP14151 372 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 PRSS3P35030 304 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 GNB2P62879 340 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 ZNF846Q147U1 533 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 GAPTQ8N292 157 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 OR8B3Q8NGG8 313 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 OR8B2Q96RD0 313 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 CHST6Q9GZX3 395 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 AUP1Q9Y679 476 aa15.06■□□□□ 0
PTX4-201ENST00000293922 SULT1C2O00338 296 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 MGST3O14880 152 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 HILS1P60008 231 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 PAX8Q06710 450 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 GRK1Q15835 563 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 ZNF841Q6ZN19 808 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 NLRC3Q7RTR2 1065 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 GDPD1Q8N9F7 314 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 OR5D13Q8NGL4 314 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 NEK7Q8TDX7 302 aa15.05■□□□□ -0
PTX4-201ENST00000293922 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms