RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 ARPC4P59998 168 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 FCN2Q15485 313 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SHEQ5VZ18 495 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 Q6ZS49 121 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TERB2Q8NHR7 220 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 Q9N2K0 584 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 IL19Q9UHD0 177 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF222Q9UK12 451 aa14.64□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SRRM5B3KS81 715 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OVOL3O00110 214 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SNAPC5O75971 98 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 KNG1P01042 644 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CD8AP01732 235 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ADH4P08319 380 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SERPINF1P36955 418 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ATP5J2P56134 94 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TSPAN5P62079 268 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF626Q68DY1 528 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SPICQ8N5J4 248 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.63□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TFF1P04155 84 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GSTT2P0CG29 244 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PAX1P15863 534 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 LMO1P25800 156 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CDKN1AP38936 164 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GRK1Q15835 563 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF69Q9UC07 566 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 DYSFO75923 2080 aa14.62□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OR5H14A6NHG9 310 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 C17orf100A8MU93 164 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PSPNO60542 156 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 CD55P08174 381 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OR5H8P0DN80 308 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ECI1P42126 302 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 NPY4RP50391 375 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 Q5PR19 223 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ASB13Q8WXK3 278 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 HYLS1Q96M11 299 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM165Q9HC07 324 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GCM1Q9NP62 436 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 RASL12Q9NYN1 266 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 LHBP01229 141 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 OR4E1P0C645 316 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TNFSF4P23510 183 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TAS2R31P59538 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 KCNJ8Q15842 424 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 C4orf46Q504U0 113 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GAPTQ8N292 157 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 DIRC2Q96SL1 478 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TREM2Q9NZC2 230 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GLS2Q9UI32 602 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 METRNQ9UJH8 293 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 GPR132Q9UNW8 380 aa14.61□□□□□ -0.07
SRSF1-201ENST00000258962 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.61□□□□□ -0.07
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