RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 ZNF674Q2M3X9 581 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 OR2T2Q6IF00 324 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ZNF561Q8N587 486 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ZFP92A6NM28 416 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TRDCB7Z8K6 153 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 WDR1O75083 606 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 MT-ND4LP03901 98 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 SULT1A1P50225 295 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RHEBQ15382 184 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 GGNQ86UU5 652 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 OR14J1Q9UGF5 321 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 A0A1W2PR80 420 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 SYNGR1O43759 233 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 MAGEA5P43359 124 aa15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 PINLYPA6NC86 204 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 DNPH1O43598 174 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 LILRB2Q8N423 598 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TMEM222Q9H0R3 208 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CD300LBA8K4G0 201 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 SIRPB1O00241 398 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CA6P23280 308 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 S100A12P80511 92 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 GNG13Q9P2W3 67 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CEP250Q9BV73 2442 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 IGFBP7Q16270 282 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 LCN15Q6UWW0 184 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 LFNGQ8NES3 379 aa15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 DEGS1O15121 323 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TUSC2O75896 110 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 SERPINA7P05543 415 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TLE1Q04724 770 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 BEND4Q6ZU67 534 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 COMMD1Q8N668 190 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TERTO14746 1132 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 IFNA17P01571 189 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 IGSF23A1L1A6 192 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 FBP1P09467 338 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 Q0VFX4 171 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 C18orf12Q96KH6 178 aa15.86■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CDS2O95674 445 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CLN3Q13286 438 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ZNF727A8MUV8 499 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 SSPNQ14714 243 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 EDARADDQ8WWZ3 215 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 NTNG2Q96CW9 530 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 BOD1Q96IK1 185 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CLN5O75503 358 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CYC1P08574 325 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RAB5AP20339 215 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RAB11AP62491 216 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 OR1C1Q15619 314 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TECTBQ96PL2 329 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RNF122Q9H9V4 155 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.85■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 LRRC3CA6NJW4 275 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 VDAC1P21796 283 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 LINC00469Q8N7U9 141 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 CCL20P78556 96 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 TLE4Q04727 773 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 GINS3Q9BRX5 216 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 UBE2CO00762 179 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 GRPP07492 148 aa15.84■□□□□ 0.13
LRP3-201ENST00000253193 OR8U8P0C7N1 319 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms