RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SMDT1Q9H4I9 107 aa22.57■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 DANCRP0C864 163 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 CDAP32320 146 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GGNBP1Q5YKI7 109 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 LURAP1LQ8IV03 231 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GJC3Q8NFK1 279 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1E2Q96JD6 320 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 RGCCQ9H4X1 137 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GLP1RP43220 463 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP82Q8N141 532 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 LRTM2Q8N967 370 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZIC4Q8N9L1 334 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT14Q96FL9 552 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GINS3Q9BRX5 216 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GLRX2Q9NS18 164 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 HSF4Q9ULV5 492 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC79Q9P2D8 2635 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 TACC2O95359 2948 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8U9P0C7N5 309 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM27E3Q08E93 113 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 RHEBQ15382 184 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8U1Q8NH10 309 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SUCNR1Q9BXA5 334 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS10P5Q9NQ39 176 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PROCRQ9UNN8 238 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GW64 132 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR137BO60478 399 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-9P01782 118 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 DTYMKP23919 212 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ASCL1P50553 236 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 CRIP3Q6Q6R5 217 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 LFNGQ8NES3 379 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 MALSU1Q96EH3 234 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCC1Q96S66 551 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PBDC1Q9BVG4 233 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA10Q9UJ72 324 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 FBN2P35556 2912 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 C9JQL5 133 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA2P20848 420 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 MSR1P21757 451 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY1P47900 373 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB1AP62820 205 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 HGFACQ04756 655 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXRED2Q8IWF2 684 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS50Q9UI38 385 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 MSTNO14793 375 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 AGPAT2O15120 278 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 IL13RA2Q14627 380 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 GUK1Q16774 197 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf128Q5T292 105 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SECTM1Q8WVN6 248 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 NECAP2Q9NVZ3 263 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 CSMD1Q96PZ7 3565 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 CSMD2Q7Z408 3487 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF724A8MTY0 619 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PPT1P50897 306 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF787Q6DD87 383 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QL2Q7Z5L3 287 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 LYZL4Q96KX0 146 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 Q96M66 194 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF44P15621 663 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CARD17Q5XLA6 110 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H3AQ71DI3 136 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1J1Q8NGS3 322 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 NELFAQ9H3P2 528 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPR2Q14571 2701 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf77A4D0Y5 90 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H3AP68431 136 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2V2Q15819 145 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MIDNQ504T8 468 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SPSB1Q96BD6 273 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 NAA60Q9H7X0 242 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 GP6Q9HCN6 339 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C1Q1 480 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5H8P0DN80 308 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFBP2P18065 325 aa22.5■■□□□ 1.19
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