RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 NAP1L6A6NFF2 107 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 POM121CA8CG34 1229 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF732B4DXR9 585 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BUI4 141 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 LPLP06858 475 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 PAX8Q06710 450 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYND11Q15326 602 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 CDNFQ49AH0 187 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-216ENST00000628306 DMRTC1Q5HYR2 192 aa20.02■□□□□ 0.8
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CAPNS1-216ENST00000628306 Q96M66 194 aa20.02■□□□□ 0.8
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A18PA6NE21 464 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A16PA6NEW6 464 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A7PA6NKC0 464 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A22PA8MWA6 464 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A13PP0C7W8 464 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A14PP0C7W9 464 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A24PP0C7X0 464 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 J3QT63 122 aa19.97■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 SOCS1O15524 211 aa19.97■□□□□ 0.79
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CAPNS1-216ENST00000628306 CBX5P45973 191 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8G1Q15617 311 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PLAC9Q5JTB6 97 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 OLFML2AQ68BL7 652 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM229BQ8NBD8 167 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10K1Q8NGX5 313 aa19.96■□□□□ 0.79
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