RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ERVFC1-1P60608 527 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CAPNS2Q96L46 248 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 RNF150Q9ULK6 438 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.53□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 MSR1P21757 451 aa8.52□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 CRYGSP22914 178 aa8.52□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 OPRM1P35372 400 aa8.52□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 FXYD4P59646 89 aa8.52□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 P2RY6Q15077 328 aa8.52□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 C4orf17Q53FE4 359 aa8.52□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.52□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.52□□□□□ -1.04
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 FAM221AA4D161 298 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ADAM20O43506 726 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TUSC2O75896 110 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1D-12P01611 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 NUBP1P53384 320 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 RAB11AP62491 216 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CARFQ8N187 725 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 GJC3Q8NFK1 279 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 LRFN1Q9P244 771 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 XKRY2A2RUG3 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CD55P08174 381 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 OR4A8P0C604 315 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 GFERP55789 205 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 ZNF154Q13106 437 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 RNF208Q9H0X6 261 aa8.52□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.52□□□□□ -1.05
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HCG18-242ENST00000602319 B4DGG1 531 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 VDAC1P21796 283 aa8.51□□□□□ -1.05
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HCG18-242ENST00000602319 TEX38Q6PEX7 206 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 PARM1Q6UWI2 310 aa8.51□□□□□ -1.05
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HCG18-242ENST00000602319 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.51□□□□□ -1.05
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HCG18-242ENST00000602319 HERV-K104P61576 105 aa8.51□□□□□ -1.05
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HCG18-242ENST00000602319 LINC00614P0C842 121 aa8.51□□□□□ -1.05
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HCG18-242ENST00000602319 NSDHLQ15738 373 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 OSR2Q8N2R0 312 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 GPR173Q9NS66 373 aa8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 YPEL1O60688 119 aa8.5□□□□□ -1.05
HCG18-242ENST00000602319 CYTIPO60759 359 aa8.5□□□□□ -1.05
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