RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GW64	132 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	UMAD1	C9J7I0	102 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TUSC2	O75896	110 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-H	P01893	362 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	JMJD7	P0C870	316 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CALHM2	Q9HA72	323 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF732	B4DXR9	585 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PITX3	O75364	302 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF883	P0CG24	379 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	MMP9	P14780	707 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	LMO1	P25800	156 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	S100G	P29377	79 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PLP2	Q04941	152 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	NEK7	Q8TDX7	302 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	IL22RA2	Q969J5	263 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	APH1A	Q96BI3	265 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TUBA4B	Q9H853	241 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA12A	O43301	675 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	VDAC1	P21796	283 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1D1	P51857	326 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RAB5B	P61020	215 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	VAMP2	P63027	116 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	BATF2	Q8N1L9	274 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	GAPT	Q8N292	157 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	GPR87	Q9BY21	358 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SPRY4	Q9C004	299 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		15.79	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A20	A6NK97	555 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SCT	P09683	121 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	UCP1	P25874	307 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	FHIT	P49789	147 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		15.78	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559		K7N7A8	449 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	IFNA4	P05014	189 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RAB1A	P62820	205 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	BAX	Q07812	192 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RNF212	Q495C1	297 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	OR8G5	Q8NG78	346 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf79	Q96F83	325 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		15.77	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR5B21	A6NL26	309 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CD300LB	A8K4G0	201 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SLC34A2	O95436	690 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CCL2	P13500	99 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	NMS	Q5H8A3	153 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF573	Q86YE8	665 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		15.77	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD17	A6NE02	478 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	C21orf140	B9A014	251 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559		H0Y980	276 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM20	O43506	726 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	MT-ND4L	P03901	98 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CELA3A	P09093	270 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	HERPUD1	Q15011	391 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	OR1C1	Q15619	314 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	AWAT1	Q58HT5	328 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CLCC1	Q96S66	551 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PCSK5	Q92824	1860 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF23	A1L1A6	192 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF98	A6NK75	572 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	SSSCA1	O60232	199 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	C1QL1	O75973	258 aa		15.76	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	15.76	■□□□□ 0.11

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