RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561623.5

GTF3C1-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,015 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-202ENST00000561623 TNFSF14O43557 240 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 KLK2P20151 261 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ATP6V0CP27449 155 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 PPP1CAP62136 330 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 MGAT2Q10469 447 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CD226Q15762 336 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ASB5Q8WWX0 329 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 NRAPQ86VF7 1730 aa9.01□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ASB10Q8WXI3 467 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ZNF391Q9UJN7 358 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 RAB29O14966 203 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CBR3O75828 277 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ZFP64Q9NPA5 681 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CCL28Q9NRJ3 127 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ARID1AO14497 2285 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SNURFLB1AK76 121 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SPRY3O43610 288 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 C1QL1O75973 258 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 PRF1P14222 555 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 OR2T6Q8NHC8 308 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ALG14Q96F25 216 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 OR51M1Q9H341 326 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 VSIG8P0DPA2 414 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 HYAL1Q12794 435 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 Q56UQ5 140 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 LRRC61Q9BV99 259 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ACTL6AO96019 429 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 FNDC7Q5VTL7 733 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 Q6ZS52 159 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 LYG1Q8N1E2 194 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 DIRC3C9JPN6 131 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 GLB1P16278 677 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SULT1A2P50226 295 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 RUNX1Q01196 453 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ZIC1Q15915 447 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 MOB3AQ96BX8 217 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 K7EQS6 105 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SIAH2O43255 324 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 FAM87AP0C7U9 286 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 OR3A1P47881 315 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 KMT5CQ86Y97 462 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CCL7P80098 99 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 HRKO00198 91 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CD160O95971 181 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 RNF2Q99496 336 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 OR2M5A3KFT3 312 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SLC22A20A6NK97 555 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SEMA7AO75326 666 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SEC11BP0C7V7 166 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 FZD5Q13467 585 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 RND1Q92730 232 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 TRDCB7Z8K6 153 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 GOSR1O95249 250 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 HLA-DQB1P01920 261 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 DDTP30046 118 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ATP6V1FQ16864 119 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 PIGYQ3MUY2 71 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.99□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 CD99P14209 185 aa8.98□□□□□ -0.97
GTF3C1-202ENST00000561623 ORM2P19652 201 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms