RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GTI1 187 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TVP23AA6NH52 213 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C9JQL5 133 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP5D1E7EU14 171 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 F6UZH7 168 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DHHO43323 396 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SCGB1D2O95969 90 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AMBPP02760 352 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TACSTD2P09758 323 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGC1P0CF51 173 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ALOX5APP20292 161 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PTGER4P35408 488 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC6A9P48067 706 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM33P57088 247 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAM8P78325 824 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 NRN1LQ496H8 165 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CARD17Q5XLA6 110 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AWAT2Q6E213 333 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX38Q6PEX7 206 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD3Q8WU67 409 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TBX5Q99593 518 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf198Q9H425 327 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CALHM2Q9HA72 323 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 APC2O95996 2303 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CELP19835 753 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ROM1Q03395 351 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C3AR1Q16581 482 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C4orf36Q96KX1 117 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLITRK2Q9H156 845 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NELFAQ9H3P2 528 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PRORYQ9H606 182 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 VAX2Q9UIW0 290 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ACACAQ13085 2346 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GTH9 108 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SERPINE3A8MV23 424 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QLW9 94 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PLPP2O43688 288 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR1O75083 606 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD16AO95870 558 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 HPRT1P00492 218 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4A8P0C604 315 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF19P17023 458 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MSR1P21757 451 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8NA96 180 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52N5Q8NH56 324 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52I2Q8NH67 350 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TMED6Q8WW62 240 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TOMM40LQ969M1 308 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35E1Q96K37 410 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SMPXQ9UHP9 88 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NAGKQ9UJ70 344 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.27□□□□□ -1.41
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