RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 M0QZ24 198 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 EBAG9O00559 213 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 GABRPO00591 440 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 HSPB6O14558 160 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SH2D1BO14796 132 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 MGST3O14880 152 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 TIMM23O14925 209 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 DEGS1O15121 323 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 CDRT1O95170 752 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 HCKP08631 526 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF44P15621 663 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 CDK2P24941 298 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ERP29P30040 261 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 P2RX3P56373 397 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC34A1Q06495 639 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB40BQ12829 278 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 HERPUD1Q15011 391 aa5.86□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF529Q6P280 563 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SERPINA12Q8IW75 414 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5AK2Q8NH90 309 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 RFESDQ8TAC1 157 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 CORO2AQ92828 525 aa5.86□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 Q96MT0 163 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 MMP27Q9H306 513 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 NEK6Q9HC98 313 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ING4Q9UNL4 249 aa5.86□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 TCF19Q9Y242 345 aa5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.86□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.86□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 VGLL3A8MV65 326 aa5.85□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ASCL4Q6XD76 172 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 Q8IYB0 196 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.85□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.85□□□□□ -1.47
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PRPF4B-208ENST00000490653 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 CYGBQ8WWM9 190 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 CFHR4Q92496 578 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 JAM3Q9BX67 310 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 KIF25Q9UIL4 384 aa5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A1W2PPE3 182 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM212A6NML5 194 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 SNTNA6NMZ2 147 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 H0YJX3 145 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 LY6LH3BQJ8 138 aa5.84□□□□□ -1.47
PRPF4B-208ENST00000490653 PIN1P1O15428 100 aa5.84□□□□□ -1.47
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