RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	CD2	P06729	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	UCHL1	P09936	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OCM2	P0CE71	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CPE	P16870	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF20	P17024	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CEL	P19835	753 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CD34	P28906	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	BDKRB2	P30411	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TGFBR2	P37173	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	VHL	P40337	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR3A4P	P47883	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	QRFP	P83859	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MED21	Q13503	144 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	THRSP	Q92748	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A0A0U1RQK1	487 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SH2D1B	O14796	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NPFF	O15130	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RGS10	O43665	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	INMT	O95050	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NDUFA7	O95182	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GLA	P06280	429 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NDUFB7	P17568	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PRKACA	P17612	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GAL	P22466	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	DUSP1	P28562	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MAP2K4	P45985	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GABRA2	P47869	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SOX2	P48431	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	KCNJ3	P48549	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	DYNLT3	P51808	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	P2RX3	P56373	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SSX1	Q16384	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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