RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 OR1P1Q8NH06 330 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 NAT6Q93015 286 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 SYT3Q9BQG1 590 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 NAA60Q9H7X0 242 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 WNT16Q9UBV4 365 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 FCGR2AP12318 317 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 IL12BP29460 328 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 Q8NFD4 153 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.91□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 NDUFS8O00217 210 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 HSPA12AO43301 675 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 PIAS2O75928 621 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 SCGNO76038 276 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 ZNF728P0DKX0 622 aa6.9□□□□□ -1.3
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TPM3-215ENST00000469717 PAX5Q02548 391 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 SLC22A25Q6T423 547 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 AKAP6Q13023 2319 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 A0A1B0GU03 582 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 CEACAM6P40199 344 aa6.9□□□□□ -1.3
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TPM3-215ENST00000469717 TLE3Q04726 772 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 BATFQ16520 125 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 TDRG1Q3Y452 100 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 RTL6Q6ICC9 239 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 CALHM1Q8IU99 346 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 LGI3Q8N145 548 aa6.9□□□□□ -1.3
TPM3-215ENST00000469717 RSG1Q9BU20 258 aa6.9□□□□□ -1.3
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TPM3-215ENST00000469717 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CLDN34H7C241 214 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 DVL1O14640 695 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 OPN1MWP04001 364 aa6.9□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 TDGF1P3P51864 188 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 LYZL4Q96KX0 146 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 FBRSQ9HAH7 460 aa6.9□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 F5H5K5 113 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 MT-ATP6P00846 226 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 DUSP1P28562 367 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.314e-13■■■■□ 25.8
TPM3-215ENST00000469717 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 GPR157Q5UAW9 335 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 Q6ZPA2 131 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 RAB24Q969Q5 203 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 C18orf12Q96KH6 178 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CDH20Q9HBT6 801 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 COL4A2P08572 1712 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 A0A1B0GW64 132 aa6.89□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 TFPI2P48307 235 aa6.89□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 DIRC2Q96SL1 478 aa6.89□□□□□ -1.31
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TPM3-215ENST00000469717 FUT9Q9Y231 359 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CA11O75493 328 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 GUSBP08236 651 aa6.89□□□□□ -1.31
TPM3-215ENST00000469717 CD46P15529 392 aa6.89□□□□□ -1.31
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