RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 CEACAM19Q7Z692 300 aa12.13□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.13□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SESN1Q9Y6P5 492 aa12.13□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FUOMA2VDF0 154 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 DENRO43583 198 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ARG1P05089 322 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 UCHL1P09936 223 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CPEP16870 476 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 RELBQ01201 579 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF626Q68DY1 528 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CDH26Q8IXH8 852 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 DYNAPQ8N1N2 210 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 NKAIN3Q8N8D7 197 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SUMF2Q8NBJ7 301 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 BEND2Q8NDZ0 799 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 OR13D1Q8NGV5 346 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CORO2AQ92828 525 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CYYR1Q96J86 154 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MGLLQ99685 303 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 IFT22Q9H7X7 185 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TCF7L1Q9HCS4 588 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 KIF25Q9UIL4 384 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FAM172BPA6NC97 362 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GPR137BO60478 399 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GTF2F2P13984 249 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CDK2P24941 298 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CFPP27918 469 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GLP1RP43220 463 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GABARAPL2P60520 117 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SSX1Q16384 188 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 HSD17B12Q53GQ0 312 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 UTF1Q5T230 341 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 BRICD5Q6PL45 260 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF367Q7RTV3 350 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM104Q8NE00 496 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 OR13A1Q8NGR1 328 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 DPAGT1Q9H3H5 408 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 KCNK15Q9H427 330 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 BANF2Q9H503 90 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R3Q9NYW6 316 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 C1RLQ9NZP8 487 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MEIKINA0A087WXM9 373 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV39A0A0B4J263 110 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MEGF11A6BM72 1044 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 H3BUX3 64 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CGB3P0DN86 165 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CGB7P0DN87 165 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SRMP19623 302 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MDKP21741 143 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS4P56470 323 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FOXL1Q12952 345 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MPV17LQ2QL34 196 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 PLA1AQ53H76 456 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ATAD3CQ5T2N8 411 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00596Q86U02 117 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 PHYHIPQ92561 330 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 DYRK2Q92630 601 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GFI1Q99684 422 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 UQCC2Q9BRT2 126 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MEGF9Q9H1U4 602 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 Q9H521 79 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 VPREB3Q9UKI3 123 aa12.1□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MGMTP16455 207 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FABP5Q01469 135 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 PAX5Q02548 391 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GPR176Q14439 515 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 LY6EQ16553 131 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 GLT8D1Q68CQ7 371 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 HEPN1Q6WQI6 88 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 MRGPRDQ8TDS7 321 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FAM46BQ96A09 425 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 Q96M66 194 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 SSX3Q99909 188 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC7AQ9BXN2 247 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 BARHL1Q9BZE3 327 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF286AQ9HBT8 521 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 CALYQ9NYX4 217 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 OR6C3Q9NZP0 311 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG1-201ENST00000361211 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms