RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 OPRM1P35372 400 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 RRADP55042 308 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 CASP6P55212 293 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF695Q8IW36 515 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 LRFN1Q9P244 771 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 NAT8Q9UHE5 227 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 PIGLQ9Y2B2 252 aa16.61■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 XKRY2A2RUG3 117 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 LILRA5A6NI73 299 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 C10orf142B7Z368 130 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 E9PLN8 166 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 EPHA1P21709 976 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 MSX1P28360 303 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 ERVFC1-1P60608 527 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 GAGE1Q13065 139 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 PRDX4Q13162 271 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 MFAP5Q13361 173 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 GJC3Q8NFK1 279 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 OR11L1Q8NGX0 322 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 IL22RA2Q969J5 263 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 ONECUT2O95948 504 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 IFNA5P01569 189 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 OMGP23515 440 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM211Q6ICI0 200 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 MRGPRGQ86SM5 289 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 GPR137CQ8N3F9 429 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 RNF138Q8WVD3 245 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 PIGTQ969N2 578 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 OXGR1Q96P68 337 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 SNHG12Q9BXW3 62 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 IL36GQ9NZH8 169 aa16.6■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 FASLGP48023 281 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 MYBPHQ13203 477 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 NMSQ5H8A3 153 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 C1orf189Q5VU69 101 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF787Q6DD87 383 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 Q6ZS49 121 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 SYT13Q7L8C5 426 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 SPEM1Q8N4L4 309 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 ARID1AO14497 2285 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 PPYP01298 95 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 AADACP22760 399 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 HIST1H3AP68431 136 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 RUNX1Q01196 453 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 P4HA3Q7Z4N8 544 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 RELTQ969Z4 430 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 Q9N2K0 584 aa16.58■□□□□ 0.25
MVB12A-201ENST00000317040 EXPH5Q8NEV8 1989 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM210A6NLX4 147 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 MARCH11A6NNE9 402 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 VDAC1P21796 283 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 APLNRP35414 380 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 BLKP51451 505 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 NSDHLQ15738 373 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 DCAF10Q5QP82 559 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 GPR27Q9NS67 375 aa16.58■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 MSR1P21757 451 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 TDGF1P3P51864 188 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 PAX5Q02548 391 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 C1orf194Q5T5A4 169 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM123Q8N131 208 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 NAXEQ8NCW5 288 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 B4DGG1 531 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 H3BMH7 237 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 CST7O76096 145 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 TYMSP04818 313 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 SLC25A6P12236 298 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF880Q6PDB4 577 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 OR51G1Q8NGK1 321 aa16.57■□□□□ 0.24
MVB12A-201ENST00000317040 OR5B12Q96R08 314 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms